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#Tecnología #Coronavirus: Departamento de Energía de #USA pone a disposición la supercomputadora más poderosa del mundo, Summit, para ayudar en la lucha contra #COVID19

Posted: 11 March, 2020 at 9:01 am   /   by   /   comments (0)

La tecnología IBM y NVIDIA colabora en la identificación de compuestos que podrían guiar a
los investigadores a una cura
*Por Dave Turek, Vicepresidente de Informática Técnica, IBM Cognitive Systems
La tecnología ha estado en el centro de los avances científicos durante décadas. Hace apenas
16 años, la supercomputadora Blue Gene de IBM debutó como la primera supercomputadora
en romper la barrera “petascale” y pasó a desempeñar un papel crítico en la secuenciación
del genoma humano.
Ese avance ayudó a abrir la puerta a nuevos fármacos y tratamientos, y Blue Gene pasó a
simular aproximadamente el uno por ciento de una corteza cerebral humana, que contiene
1.600 millones de neuronas con aproximadamente 9 billones de conexiones, lo que llevó a
una mayor comprensión de la computadora más compleja jamás creada: el cerebro humano.
Pero algunos problemas requieren una respuesta más inmediata, y es por eso que el
Departamento de Energía de los Estados Unidos anunció un nuevo y poderoso aliado en la
lucha contra la epidemia COVID-19 que ha arrasado 84 países, y todos los continentes excepto
la Antártida según el último resumen de los CDC: el superordenador Summit construido por
IBM.
Los virus infectan las células uniéndose a ellas y usando una “aguja” para inyectar su material
genético en la célula huésped. Al tratar de entender nuevos compuestos biológicos, como los
virus, los investigadores de los laboratorios húmedos crecen el microorganismo y ven cómo
reacciona en la vida real a la introducción de nuevos compuestos, pero esto puede ser un
proceso lento sin computadoras capaces de realizar simulaciones para reducir el rango de
variables potenciales, pero incluso entonces hay desafíos. Las simulaciones por
computadoras pueden examinar cómo reaccionan las diferentes variables con diferentes
virus, pero cuando cada una de estas variables individuales está compuesta por millones o
incluso miles de millones de datos únicos y con la necesidad de ejecutar múltiples
simulaciones, esto puede convertirse rápidamente en un proceso que consume mucho
tiempo utilizando hardware básico.
Utilizando Summit, los investigadores fueron capaces de simular 8.000 compuestos en
cuestión de días para modelar que podrían afectar ese proceso de infección al pico del virus,
y han identificado 77 compuestos de moléculas pequeñas, como medicamentos y
compuestos naturales, que han demostrado el potencial de afectar la capacidad de COVID-19
para acoplar e infectar las células huésped.
“Se necesitaba una computadora como Summit para obtener rápidamente los resultados de
simulación necesarios. Nos llevó uno o dos días, mientras que habría tomado meses en una
computadora normal”, dijo Jeremy Smith, Presidente de la junta de gobierno de la
Universidad de Tennessee, director del Centro UT/ORNL (Oak Ridge National Laboratory) para
biofísica molecular e investigador principal en el estudio. “Nuestros resultados no significan
que hayamos encontrado una cura o tratamiento para el coronavirus Wuhan. Estamos muy
esperanzados de que nuestros hallazgos computacionales informarán estudios futuros y
proporcionarán un marco que los experimentalistas utilizarán para investigar más a fondo
estos compuestos. Sólo entonces sabremos si alguno de ellos exhibe las características
necesarias para mitigar este virus”.
Summit dio a los investigadores su enorme capacidad de procesamiento de datos, habilitada
por sus 4,608 nodos de servidor IBM Power Systems AC922, cada uno equipado con dos CPU
IBM POWER9 y seis GPU NVIDIA Tensorcore V100, lo que le da un rendimiento máximo de
200 petaflops, diseñados para ser más potentes que un millón de portátiles de gama alta.
Desde que debutó como la supercomputadora más poderosa del mundo en 2018,ha
cimentado su título impulsando investigaciones pioneras para ayudar a entender los orígenes
del universo, ayudando a entender la crisis de los opioides, y mostrando cómo los humanos
serían capaces de aterrizar en Marte. Summit, y su supercomputadora hermana Sierra, fueron
entregadas simultáneamente por IBM una hazaña inigualable que es un testimonio de la
dedicación de IBMers y nuestros socios en proporcionar tecnología innovadora para la
evolución de la humanidad, y en este caso esperamos ver los resultados y relevancia de
Summit en esta última búsqueda.

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